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identifier ERS1247255
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076145
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076145
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:00Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E2A11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E2A11
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.070769737
arcsine_hatching_success　 0.911738291
area　 Torre Guajar
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Upuidae
bird_order　 Upupiformes
broken_eggs　 0
brood_size　 5
clutch_size　 8
code_id_statistica　 2
coll_date_juliane_days　 120
collection date　 5/1/07 0:00
collection_timestamp　 5/1/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/4/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1039
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 4.241916611E8
enterococcus_density　 9459.327578
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 11.2
estefania_plates　 2A11
extracted DNA avail now　 true
feathers　 false
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 0.5
fledging_date　 5/22/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/4/07
hatching_success　 0.625
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Eurasian hoopoe
host scientific name　 Upupiformes
host subject id　 Abubilla.11.2
host taxid　 57439
latitude　 37.38953889
lay_date_juliane_days　 98
laying_date　 7/8/07
log_enterobacteriaceae_density　 8.627562128
log_enterococcus_density　 3.975906175
log_mesophiles_density　 9.536481657
log_rel_growth_enterobact　 1.599718736
log_rel_growth_enterococcus　 0.691011065
log_rel_growth_mesophiles　 1.524813241
log_rel_growth_staphylococcus　 -1.414907679
log_staphylococcus_density　 0.25588124
longitude　 -3.098552778
mesophiles_density　 3439391846
nest_type　 hole
number_fledging　 4
number_sampled_eggs　 8
observer　 Juanma
physical_location_1　 U Granada
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P2E11
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 38.7849426
rel_growth_enterococcus　 3.909203842
rel_growth_staphylococcus　 -0.961532645
relative_growth_mesophiles　 32.48214254
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E2A11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Abubilla.11.2
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 2
sampling_code_id　 161
species name　 Upupa epops
staphylococcus_density　 0.802524764
storing_days　 3
unhatched_eggs　 3
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1529819
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076145
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600711
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:48:36Z
dateModified 2021-09-24T10:04:04Z
datePublished 2016-07-14T16:22:14Z