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identifier ERS1247291
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076181
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076181
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:01Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E2D07.r.EMPbird.v4.NoIndex.L001
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E2D07
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.070769737
arcsine_hatching_success　 0.785398163
area　 Hernan-Valle
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Muscicapidae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 2
clutch_size　 4
code_id_statistica　 190
coll_date_juliane_days　 117
collection date　 4/28/07 0:00
collection_timestamp　 4/28/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/1/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1134
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 4.248456977
enterococcus_density　 1.118014994
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 Gol 4.1
estefania_plates　 2D07
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 0.5
fledging_date　 5/25/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/13/07
hatching_success　 0.5
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Black weathear
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Collalbanegra.Col4.1
host taxid　 391703
latitude　 37.37229722
lay_date_juliane_days　 112
laying_date　 7/22/07
log_enterobacteriaceae_density　 0.720031641
log_enterococcus_density　 0.32592903
log_mesophiles_density　 8.826598879
log_rel_growth_enterobact　 5.448990212
log_rel_growth_enterococcus　 -0.001275936
log_rel_growth_mesophiles　 -2.221848642
log_rel_growth_staphylococcus　 0
log_staphylococcus_density　 0
longitude　 -3.066655556
mesophiles_density　 6.708089963E8
nest_type　 hole
number_fledging　 2
number_sampled_eggs　 4
observer　 Juanma
physical_location_1　 U Granada
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P2C06
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 281182.7457
rel_growth_enterococcus　 -0.00293364
rel_growth_staphylococcus　 0
relative_growth_mesophiles　 -0.993999999
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E2D07.r.EMPbird.v4.NoIndex.L001
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Collalbanegra.Col4.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 140
species name　 Oenanthe leucura
staphylococcus_density　 0
storing_days　 3
unhatched_eggs　 2
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1529855
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076181
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600747
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:48:44Z
dateModified 2021-09-24T10:04:13Z
datePublished 2016-07-14T16:22:14Z