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identifier ERS1247318
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076208
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076208
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:02Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E2F07.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E2F07
arcsine_fledge_success_brood　 0.089562407
arcsine_fledge_success_clutch　 0.089562407
arcsine_hatching_success　 1.570796327
area　 Benalua
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Sturnidae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 5
clutch_size　 5
code_id_statistica　 263
coll_date_juliane_days　 118
collection date　 4/29/07 0:00
collection_timestamp　 4/29/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/1/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 907
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 3.468830546
enterococcus_density　 1.019935808
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 32.2
estefania_plates　 2F07
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 0.8
fledge_success_clutch　 0.8
fledging_date　 5/16/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 4/29/07
hatching_success　 1
hatching_synchrony　 syn
host common name　 Sptoless starling
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Estornino.32.2
host taxid　 381112
latitude　 37.32783056
lay_date_juliane_days　 100
laying_date　 7/10/07
log_enterobacteriaceae_density　 0.650193887
log_enterococcus_density　 0.305337568
log_mesophiles_density　 9.554906342
log_rel_growth_enterobact　 -4.722059269
log_rel_growth_enterococcus　 -1.992126376
log_rel_growth_mesophiles　 2.330993193
log_rel_growth_staphylococcus　 0.093151811
log_staphylococcus_density　 0.093151811
longitude　 -3.138858333
mesophiles_density　 3588445393
nest_type　 hole
number_fledging　 4
number_sampled_eggs　 5
observer　 Juanma
physical_location_1　 U Granada
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 true
platero_plates　 P2C08
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 -0.999981036
rel_growth_enterococcus　 -0.98981705
rel_growth_staphylococcus　 0.239229693
relative_growth_mesophiles　 213.2857015
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E2F07.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Estornino.32.2
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 2
sampling_code_id　 137
species name　 Sturnus unicolor
staphylococcus_density　 0.239229693
storing_days　 2
unhatched_eggs　 0
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1529882
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076208
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600774
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:48:49Z
dateModified 2021-09-24T10:04:20Z
datePublished 2016-07-14T16:22:14Z