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identifier ERS1247321
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076211
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076211
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:02Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E2F10.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E2F10
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.095011212
arcsine_hatching_success　 1.249045772
area　 Cortijo Hedionda
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Paridae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 9
clutch_size　 10
code_id_statistica　 116
coll_date_juliane_days　 121
collection date　 5/2/07 0:00
collection_timestamp　 5/2/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/14/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1280
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 6.274424632E8
enterococcus_density　 9.254776333
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 C-12.1
estefania_plates　 2F10
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 0.9
fledging_date　 5/29/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/13/07
hatching_success　 0.9
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Great tit
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Carbonero.C.12.1
host taxid　 9157
latitude　 37.32121667
lay_date_juliane_days　 109
laying_date　 7/19/07
log_enterobacteriaceae_density　 8.797573908
log_enterococcus_density　 1.010926192
log_mesophiles_density　 7.17323755
log_rel_growth_enterobact　 -2.455931759
log_rel_growth_enterococcus　 1.887542157
log_rel_growth_mesophiles　 -0.722450976
log_rel_growth_staphylococcus　 -0.353124383
log_staphylococcus_density　 0.353124383
longitude　 -3.024819444
mesophiles_density　 1.49017585E7
nest_type　 hole
number_fledging　 9
number_sampled_eggs　 10
observer　 Juanma
physical_location_1　 U Granada
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P2E8
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 -0.996499998
rel_growth_enterococcus　 76.18664362
rel_growth_staphylococcus　 -0.556518389
relative_growth_mesophiles　 -0.810526261
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E2F10.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Carbonero.C.12.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 168
species name　 Parus major
staphylococcus_density　 1.254884926
storing_days　 12
unhatched_eggs　 1
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1529885
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076211
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600777
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:48:49Z
dateModified 2021-09-24T10:04:21Z
datePublished 2016-07-14T16:22:14Z