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identifier ERS1247323
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076213
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076213
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:02Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E2F12.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E2F12
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.092714783
arcsine_hatching_success　 Missing: Not collected
area　 Cortijo Perro
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Upuidae
bird_order　 Upupiformes
broken_eggs　 0
brood_size　 6
clutch_size　 7
code_id_statistica　 29
coll_date_juliane_days　 119
collection date　 4/30/07 0:00
collection_timestamp　 4/30/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/5/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1160
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 4.069390781E7
enterococcus_density　 276.7401403
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 717
estefania_plates　 2F12
extracted DNA avail now　 true
feathers　 false
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 0.857142857
fledging_date　 5/22/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/3/07
hatching_success　 Missing: Not collected
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Eurasian hoopoe
host scientific name　 Upupiformes
host subject id　 Abubilla.717.2
host taxid　 57439
latitude　 37.32654722
lay_date_juliane_days　 98
laying_date　 7/8/07
log_enterobacteriaceae_density　 7.609529408
log_enterococcus_density　 2.443638651
log_mesophiles_density　 7.133829761
log_rel_growth_enterobact　 Missing: Not provided
log_rel_growth_enterococcus　 Missing: Not provided
log_rel_growth_mesophiles　 Missing: Not provided
log_rel_growth_staphylococcus　 Missing: Not provided
log_staphylococcus_density　 2.682435293
longitude　 -3.059219444
mesophiles_density　 1.360911015E7
nest_type　 hole
number_fledging　 6
number_sampled_eggs　 7
observer　 Manolo
physical_location_1　 U Granada
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P2F011
predated　 No
public　 true
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E2F12.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Abubilla.717.2
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 2
sampling_code_id　 202
species name　 Upupa epops
staphylococcus_density　 480.3215348
storing_days　 5
unhatched_eggs　 1
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1529887
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076213
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600779
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:48:50Z
dateModified 2021-09-24T10:04:21Z
datePublished 2016-07-14T16:22:14Z