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identifier ERS1247374
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076264
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076264
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:03Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E3B10.r.EMPbird.v4.NoIndex.L001
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E3B10
arcsine_fledge_success_brood　 0.081740653
arcsine_fledge_success_clutch　 0.081740653
arcsine_hatching_success　 1.047197551
area　 Cortijo Perro
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Muscicapidae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 3
clutch_size　 3
code_id_statistica　 189
coll_date_juliane_days　 127
collection date　 5/8/07 0:00
collection_timestamp　 5/8/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/12/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1160
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 1740479.512
enterococcus_density　 1
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 COL32
estefania_plates　 3B10
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 0.666666667
fledge_success_clutch　 0.666666667
fledging_date　 5/24/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/9/07
hatching_success　 0.75
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Black weathear
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Collalbanegra.Col3.2
host taxid　 391703
latitude　 37.32654722
lay_date_juliane_days　 109
laying_date　 7/19/07
log_enterobacteriaceae_density　 6.240669165
log_enterococcus_density　 0.301029996
log_mesophiles_density　 6.378196961
log_rel_growth_enterobact　 6.240669165
log_rel_growth_enterococcus　 -1.635069477
log_rel_growth_mesophiles　 -1.369745634
log_rel_growth_staphylococcus　 0
log_staphylococcus_density　 0
longitude　 -3.059219444
mesophiles_density　 2388893.448
nest_type　 hole
number_fledging　 2
number_sampled_eggs　 3
observer　 Juanma
physical_location_1　 U Granada
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P3C05
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 1740479.512
rel_growth_enterococcus　 -0.976829761
rel_growth_staphylococcus　 0
relative_growth_mesophiles　 -0.957317056
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E3B10.r.EMPbird.v4.NoIndex.L001
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Collalbanegra.Col3.2
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 2
sampling_code_id　 298
species name　 Oenanthe leucura
staphylococcus_density　 0
storing_days　 4
unhatched_eggs　 1
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1529938
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076264
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600830
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:48:59Z
dateModified 2021-09-24T10:04:42Z
datePublished 2016-07-14T16:22:14Z