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identifier ERS1247440
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076330
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076330
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:05Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E3G02.r.EMPbird.v4.NoIndex.L001
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E3G02
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.088306435
arcsine_hatching_success　 1.079913649
area　 Tegeda
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Paridae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 7
clutch_size　 9
code_id_statistica　 130
coll_date_juliane_days　 125
collection date　 5/6/07 0:00
collection_timestamp　 5/6/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/11/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 977
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 8.698370029E8
enterococcus_density　 31.27711777
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 TEG 25.1
estefania_plates　 3G02
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 0.777777778
fledging_date　 5/31/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/19/07
hatching_success　 0.777777778
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Great tit
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Carbonero.Teg25.1
host taxid　 9157
latitude　 37.29330833
lay_date_juliane_days　 136
laying_date　 8/15/07
log_enterobacteriaceae_density　 8.939437879
log_enterococcus_density　 1.508894747
log_mesophiles_density　 7.21182272
log_rel_growth_enterobact　 -2.936498527
log_rel_growth_enterococcus　 -0.78711709
log_rel_growth_mesophiles　 0.657577298
log_rel_growth_staphylococcus　 -1.752213762
log_staphylococcus_density　 1.752213762
longitude　 -3.106508333
mesophiles_density　 1.628630984E7
nest_type　 hole
number_fledging　 7
number_sampled_eggs　 9
observer　 Juan
physical_location_1　 U Granada
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P2H05
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 -0.998842552
rel_growth_enterococcus　 -0.836738828
rel_growth_staphylococcus　 -0.982307621
relative_growth_mesophiles　 3.545454328
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E3G02.r.EMPbird.v4.NoIndex.L001
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Carbonero.Teg25.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 220
species name　 Parus major
staphylococcus_density　 55.52151083
storing_days　 5
unhatched_eggs　 2
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530004
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076330
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600896
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:49:13Z
dateModified 2021-09-24T10:05:00Z
datePublished 2016-07-14T16:23:14Z