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identifier ERS1247482
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076372
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076372
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:07Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E4B01.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E4B01
arcsine_fledge_success_brood　 0.086711161
arcsine_fledge_success_clutch　 0.077537336
arcsine_hatching_success　 1.107148718
area　 Hernan-Valle
assigned_from_geo　 true
backup　 false
bird_family　 Passeridae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 4
clutch_size　 6
code_id_statistica　 343
coll_date_juliane_days　 132
collection date　 5/13/07 0:00
collection_timestamp　 5/13/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/14/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1134
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 95841.5996
enterococcus_density　 3091.664503
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 GOR MOL 26.1.1
estefania_plates　 4B01
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 0.75
fledge_success_clutch　 0.6
fledging_date　 6/3/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/23/07
hatching_success　 0.8
hatching_synchrony　 syn
host common name　 Eurasian tree sparrow
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Gorrionmolinero.G26.1.1
host taxid　 9160
latitude　 37.37229722
lay_date_juliane_days　 123
laying_date　 8/2/07
log_enterobacteriaceae_density　 4.981558585
log_enterococcus_density　 3.49033281
log_mesophiles_density　 6.888132425
log_rel_growth_enterobact　 0.877850233
log_rel_growth_enterococcus　 -2.156270465
log_rel_growth_mesophiles　 0.193124578
log_rel_growth_staphylococcus　 -0.700631374
log_staphylococcus_density　 0.700631374
longitude　 -3.066655556
mesophiles_density　 7729161.258
nest_type　 hole
number_fledging　 3
number_sampled_eggs　 6
observer　 Juanma
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 true
platero_plates　 P3E6
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 6.548318772
rel_growth_enterococcus　 -0.993022023
rel_growth_staphylococcus　 -0.800763627
relative_growth_mesophiles　 0.559999928
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E4B01.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Gorrionmolinero.G26.1.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 325
species name　 Passer montanus
staphylococcus_density　 4.019163854
storing_days　 1
unhatched_eggs　 1
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530046
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076372
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600938
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:49:22Z
dateModified 2021-09-24T10:05:10Z
datePublished 2016-07-14T16:23:14Z