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identifier ERS1247493
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076383
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076383
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:07Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E4B11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E4B11
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.100167421
arcsine_hatching_success　 1.570796327
area　 Hernan-Valle
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Passeridae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 5
clutch_size　 5
code_id_statistica　 337
coll_date_juliane_days　 134
collection date　 5/15/07 0:00
collection_timestamp　 5/15/07
comments_in_spanish　 Huevo 3 raro
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/22/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1134
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 2.780462689E8
enterococcus_density　 3.539235332
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 C.39.2
estefania_plates　 4B11
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 1
fledging_date　 5/28/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/16/07
hatching_success　 1
hatching_synchrony　 syn
host common name　 Eurasian tree sparrow
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Gorrionmolinero.C.39.2
host taxid　 9160
latitude　 37.37229722
lay_date_juliane_days　 117
laying_date　 7/27/07
log_enterobacteriaceae_density　 8.444117073
log_enterococcus_density　 0.656982699
log_mesophiles_density　 8.525276885
log_rel_growth_enterobact　 1.687231527
log_rel_growth_enterococcus　 0.443515723
log_rel_growth_mesophiles　 1.909720462
log_rel_growth_staphylococcus　 0.236233588
log_staphylococcus_density　 0.355952703
longitude　 -3.066655556
mesophiles_density　 3.351790638E8
nest_type　 hole
number_fledging　 5
number_sampled_eggs　 5
observer　 Juanma
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 true
platero_plates　 P4D03
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 47.66665832
rel_growth_enterococcus　 1.77661537
rel_growth_staphylococcus　 0.722794943
relative_growth_mesophiles　 80.23074979
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E4B11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Gorrionmolinero.C.39.2
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 2
sampling_code_id　 369
species name　 Passer montanus
staphylococcus_density　 1.269617666
storing_days　 7
unhatched_eggs　 0
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530057
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076383
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1600949
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:49:25Z
dateModified 2021-09-24T10:05:13Z
datePublished 2016-07-14T16:23:14Z