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identifier ERS1247603
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076493
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076493
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:10Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E5C05.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E5C05
arcsine_fledge_success_brood　 0.084616364
arcsine_fledge_success_clutch　 0.084616364
arcsine_hatching_success　 1.570796327
area　 Rambla Zaraguil
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Corvidae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 7
clutch_size　 7
code_id_statistica　 363
coll_date_juliane_days　 131
collection date　 5/12/07 0:00
collection_timestamp　 5/12/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/14/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1091
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 373727.8748
enterococcus_density　 3.322025554
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 GRA 2.1
estefania_plates　 5C05
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 0.714285714
fledge_success_clutch　 0.714285714
fledging_date　 6/16/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/25/07
hatching_success　 1
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Jackdaw
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Grajilla.Gra7.1
host taxid　 30423
latitude　 37.31888611
lay_date_juliane_days　 118
laying_date　 7/28/07
log_enterobacteriaceae_density　 5.572556653
log_enterococcus_density　 0.63568733
log_mesophiles_density　 6.937071795
log_rel_growth_enterobact　 0.267605706
log_rel_growth_enterococcus　 -0.298623174
log_rel_growth_mesophiles　 -0.591759889
log_rel_growth_staphylococcus　 -0.081932669
log_staphylococcus_density　 0.081932669
longitude　 -3.087372222
mesophiles_density　 8651108.213
nest_type　 hole
number_fledging　 5
number_sampled_eggs　 7
observer　 Juan
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 true
platero_plates　 P4H06
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 0.851849573
rel_growth_enterococcus　 -0.497221352
rel_growth_staphylococcus　 -0.171929467
relative_growth_mesophiles　 -0.743999914
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E5C05.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Grajilla.Gra7.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 311
species name　 Corvus monedula
staphylococcus_density　 0.207626597
storing_days　 2
unhatched_eggs　 0
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530167
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076493
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1601059
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:49:48Z
dateModified 2021-09-24T10:02:25Z
datePublished 2016-07-14T16:23:15Z