home > sra-sample > ERS1247609
identifier ERS1247609
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076499
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076499
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:11Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E5C11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
altitude　 0
anonymized name　 E5C11
arcsine_fledge_success_brood　 Missing: Not collected
arcsine_fledge_success_clutch　 Missing: Not collected
arcsine_hatching_success　 1.047197551
area　 Calahorra
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Sturnidae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 1
brood_size　 3
clutch_size　 5
code_id_statistica　 278
coll_date_juliane_days　 151
collection date　 6/1/07 0:00
collection_timestamp　 6/1/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 6/14/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1106
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 1331541.018
enterococcus_density　 1.561534466E7
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 StE 43
estefania_plates　 5C11
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 Missing: Not collected
fledge_success_clutch　 Missing: Not collected
fledging_date　 Missing: Not collected
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 6/12/07
hatching_success　 0.75
hatching_synchrony　 syn
host common name　 Sptoless starling
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Estornino.E43.1
host taxid　 381112
latitude　 37.25371111
lay_date_juliane_days　 146
laying_date　 8/25/07
log_enterobacteriaceae_density　 6.124354876
log_enterococcus_density　 7.193551602
log_mesophiles_density　 7.0829619
log_rel_growth_enterobact　 0.698969743
log_rel_growth_enterococcus　 -6.890336654
log_rel_growth_mesophiles　 0.21748393
log_rel_growth_staphylococcus　 0
log_staphylococcus_density　 0
longitude　 -3.029825
mesophiles_density　 1.210491834E7
nest_type　 hole
number_fledging　 Missing: Not provided
number_sampled_eggs　 4
observer　 Carlos
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 true
platero_plates　 P5D08
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 3.999996996
rel_growth_enterococcus　 -0.999999871
rel_growth_staphylococcus　 0
relative_growth_mesophiles　 0.649999946
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E5C11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Estornino.E43.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 514
species name　 Sturnus unicolor
staphylococcus_density　 0
storing_days　 13
unhatched_eggs　 1
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530173
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076499
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1601065
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:49:51Z
dateModified 2021-09-24T10:02:26Z
datePublished 2016-07-14T16:23:15Z