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identifier ERS1247621
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076511
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076511
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:11Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E5D10.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E5D10
arcsine_fledge_success_brood　 0.081740653
arcsine_fledge_success_clutch　 0.081740653
arcsine_hatching_success　 1.570796327
area　 Fuentealamo
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Muscicapidae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 4
clutch_size　 4
code_id_statistica　 192
coll_date_juliane_days　 152
collection date　 6/2/07 0:00
collection_timestamp　 6/2/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 6/20/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1145
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 27773.14836
enterococcus_density　 158703.7049
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 COL 5.1
estefania_plates　 5D10
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 0.666666667
fledge_success_clutch　 0.666666667
fledging_date　 6/26/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 6/16/07
hatching_success　 1
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Black weathear
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Collalbanegra.Col5.1
host taxid　 391703
latitude　 37.34600556
lay_date_juliane_days　 145
laying_date　 8/24/07
log_enterobacteriaceae_density　 4.443640751
log_enterococcus_density　 5.200589802
log_mesophiles_density　 6.802647125
log_rel_growth_enterobact　 1.991215497
log_rel_growth_enterococcus　 -4.719006078
log_rel_growth_mesophiles　 2.244028793
log_rel_growth_staphylococcus　 0
log_staphylococcus_density　 0
longitude　 -3.061197222
mesophiles_density　 6348148.197
nest_type　 hole
number_fledging　 2
number_sampled_eggs　 4
observer　 Juanma
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P5D01
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 96.99761299
rel_growth_enterococcus　 -0.999980902
rel_growth_staphylococcus　 0
relative_growth_mesophiles　 174.3996784
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E5D10.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Collalbanegra.Col5.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 530
species name　 Oenanthe leucura
staphylococcus_density　 0
storing_days　 18
unhatched_eggs　 0
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530185
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076511
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1601077
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:49:53Z
dateModified 2021-09-24T10:02:29Z
datePublished 2016-07-14T16:23:15Z