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identifier ERS1247623
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076513
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076513
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:11Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E5D11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E5D11
arcsine_fledge_success_brood　 0.070769737
arcsine_fledge_success_clutch　 0.070769737
arcsine_hatching_success　 1.570796327
area　 Tegeda
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Strigidae
bird_order　 Strigiformes
broken_eggs　 0
brood_size　 4
clutch_size　 4
code_id_statistica　 94
coll_date_juliane_days　 152
collection date　 6/2/07 0:00
collection_timestamp　 6/2/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 6/14/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 977
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 9.146795165
enterococcus_density　 6720.685045
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 Teg 727 I 2
estefania_plates　 5D11
extracted DNA avail now　 true
feathers　 false
fledge_success_brood　 0.5
fledge_success_clutch　 0.5
fledging_date　 7/7/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 6/8/07
hatching_success　 1
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Eurasian scops-owl
host scientific name　 Strigiformes
host subject id　 Autillo.Teg727.2
host taxid　 126827
latitude　 37.29330833
lay_date_juliane_days　 129
laying_date　 8/8/07
log_enterobacteriaceae_density　 1.006328893
log_enterococcus_density　 3.827478159
log_mesophiles_density　 0
log_rel_growth_enterobact　 0.505770492
log_rel_growth_enterococcus　 3.622879945
log_rel_growth_mesophiles　 -6.335728067
log_rel_growth_staphylococcus　 -0.133876538
log_staphylococcus_density　 0
longitude　 -3.106508333
mesophiles_density　 0
nest_type　 hole
number_fledging　 2
number_sampled_eggs　 4
observer　 Juan
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P5D09
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 2.204575384
rel_growth_enterococcus　 4195.429632
rel_growth_staphylococcus　 -0.265277293
relative_growth_mesophiles　 -0.999999538
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E5D11.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Autillo.Teg727.2
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 2
sampling_code_id　 515
species name　 Otus scops
staphylococcus_density　 0
storing_days　 12
unhatched_eggs　 0
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530187
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076513
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1601079
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:49:53Z
dateModified 2021-09-24T10:02:29Z
datePublished 2016-07-14T16:23:15Z