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identifier ERS1247659
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076549
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076549
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:12Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E5G09.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E5G09
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.086711161
arcsine_hatching_success　 1.047197551
area　 Torre Guajar
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Strigidae
bird_order　 Strigiformes
broken_eggs　 0
brood_size　 3
clutch_size　 4
code_id_statistica　 78
coll_date_juliane_days　 153
collection date　 6/3/07 0:00
collection_timestamp　 6/3/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 6/20/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1039
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 113969.1934
enterococcus_density　 56984.59668
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 824
estefania_plates　 5G09
extracted DNA avail now　 true
feathers　 false
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 0.75
fledging_date　 7/12/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 6/23/07
hatching_success　 0.75
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Eurasian scops-owl
host scientific name　 Strigiformes
host subject id　 Autillo.824.1
host taxid　 126827
latitude　 37.38953889
lay_date_juliane_days　 144
laying_date　 8/23/07
log_enterobacteriaceae_density　 5.056791285
log_enterococcus_density　 4.7557651
log_mesophiles_density　 6.015395209
log_rel_growth_enterobact　 1.958603546
log_rel_growth_enterococcus　 0.857144171
log_rel_growth_mesophiles　 0.769007523
log_rel_growth_staphylococcus　 0
log_staphylococcus_density　 0
longitude　 -3.098552778
mesophiles_density　 1036083.576
nest_type　 hole
number_fledging　 3
number_sampled_eggs　 4
observer　 Juanma
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P5C08
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 89.90830203
rel_growth_enterococcus　 6.196878499
rel_growth_staphylococcus　 0
relative_growth_mesophiles　 4.874995295
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E5G09.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Autillo.824.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 535
species name　 Otus scops
staphylococcus_density　 0
storing_days　 17
unhatched_eggs　 1
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530223
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076549
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1601115
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:50:00Z
dateModified 2021-09-24T10:02:38Z
datePublished 2016-07-14T16:24:12Z