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identifier ERS1247666
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076556
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076556
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:26Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:13Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E5H04.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E5H04
arcsine_fledge_success_brood　 0.100167421
arcsine_fledge_success_clutch　 0.100167421
arcsine_hatching_success　 1.570796327
area　 Cortijo Becerra
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Hirundinidae
bird_order　 Passeriformes
broken_eggs　 0
brood_size　 5
clutch_size　 5
code_id_statistica　 296
coll_date_juliane_days　 144
collection date　 5/25/07 0:00
collection_timestamp　 5/25/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/28/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 992
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 0.32315892
enterococcus_density　 1
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 GOL 2.2
estefania_plates　 5H04
extracted DNA avail now　 true
feathers　 true
fledge_success_brood　 1
fledge_success_clutch　 1
fledging_date　 6/15/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/29/07
hatching_success　 1
hatching_synchrony　 syn
host common name　 Barn swallow
host scientific name　 Passeriformes
host subject id　 Golondrinacomun.Gol2.2
host taxid　 43150
latitude　 37.43306389
lay_date_juliane_days　 129
laying_date　 8/8/07
log_enterobacteriaceae_density　 0.121612009
log_enterococcus_density　 0.301029996
log_mesophiles_density　 5.1114795
log_rel_growth_enterobact　 -7.961978199
log_rel_growth_enterococcus　 -0.466049976
log_rel_growth_mesophiles　 -2.972110706
log_rel_growth_staphylococcus　 0.444610058
log_staphylococcus_density　 0.59200237
longitude　 -3.103047222
mesophiles_density　 129263.5682
nest_type　 hole
number_fledging　 5
number_sampled_eggs　 4
observer　 Juanma
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 false
platero_plates　 P4H03
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 -0.999999989
rel_growth_enterococcus　 -0.658059908
rel_growth_staphylococcus　 1.783620706
relative_growth_mesophiles　 -0.998933676
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E5H04.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Golondrinacomun.Gol2.2
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 2
sampling_code_id　 448
species name　 Hirundo rustica
staphylococcus_density　 2.908430284
storing_days　 3
unhatched_eggs　 0
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530230
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076556
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1601122
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:50:01Z
dateModified 2021-09-24T10:02:40Z
datePublished 2016-07-14T16:24:12Z