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identifier ERS1247744
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076634
organism bird metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-13
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076634
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-13T17:01:27Z
INSDC last update　 2016-07-13T01:15:15Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1632:1632.E6H02.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
abandoned　 No
altitude　 0
anonymized name　 E6H02
arcsine_fledge_success_brood　 0.070769737
arcsine_fledge_success_clutch　 0.070769737
arcsine_hatching_success　 Missing: Not collected
area　 Sierra Maria
assigned_from_geo　 true
backup　 true
bird_family　 Cuculidae
bird_order　 Cuculiformes
broken_eggs　 0
brood_size　 2
clutch_size　 2
code_id_statistica　 233
coll_date_juliane_days　 113
collection date　 4/24/07 0:00
collection_timestamp　 4/24/07
common name　 organismal metagenome
country　 GAZ:Spain
country_nation　 Spain
country_region　 Hoya de Guadix
culturing_date　 5/6/07
depth　 0
dna_extracted　 true
elevation　 1199
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Host-associated
empo_2　 Animal
empo_3　 Animal surface
enterobacteriaceae_density　 0
enterococcus_density　 0
env biome　 mediterranean shrubland biome
env feature　 nest of bird
env matter　 egg
env package　 host-associated
eppendorf_name　 Ma16 Crialo
estefania_plates　 6H02
extracted DNA avail now　 true
feathers　 false
fledge_success_brood　 0.5
fledge_success_clutch　 0.5
fledging_date　 5/17/07
geo loc name　 Spain:Hoya de Guadix
hatching_date　 5/7/07
hatching_success　 Missing: Not collected
hatching_synchrony　 asyn
host common name　 Great-spotted cuckoo
host scientific name　 Cuculiformes
host subject id　 Crialo.Ma16.1
host taxid　 78203
latitude　 37.71095556
lay_date_juliane_days　 110
laying_date　 7/20/07
log_enterobacteriaceae_density　 0
log_enterococcus_density　 0
log_mesophiles_density　 0.228984857
log_rel_growth_enterobact　 0
log_rel_growth_enterococcus　 0.301029996
log_rel_growth_mesophiles　 -0.228984857
log_rel_growth_staphylococcus　 0
log_staphylococcus_density　 0
longitude　 -2.164844444
mesophiles_density　 0.694278725
nest_type　 open
number_fledging　 1
number_sampled_eggs　 2
observer　 David
physical_specimen_location　 CCME
physical_specimen_remaining　 true
plants　 true
platero_plates　 P5G03
predated　 No
public　 true
rel_growth_enterobacteriaceae　 0
rel_growth_enterococcus　 1
rel_growth_staphylococcus　 0
relative_growth_mesophiles　 -0.409778341
required_sample_info_status　 completed
sample name　 qiita_sid_1632:1632.E6H02.Knight16sV4.JuannaBirdEMP.NoIndex.L005.R1.001.sequences
sample type　 bird egg shell
sample_nest　 Crialo.Ma16.1
sample_progress　 sequenced (16S)
sampling time　 1
sampling_code_id　 185
species name　 Clamator glandarius
staphylococcus_density　 0
storing_days　 12
unhatched_eggs　 0
year　 2007
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14786
sra-run　 ERR1530308
sra-submission　 ERA674159
biosample　 SAMEA4076634
sra-study　 ERP016455
sra-experiment　 ERX1601200
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674159.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-14T15:50:20Z
dateModified 2021-09-24T10:03:00Z
datePublished 2016-07-14T16:24:12Z