home > sra-sample > ERS1247940
identifier ERS1247940
type sra-sample
sameAs
biosample　 SAMEA4076830
organism marine metagenome
attributes
ENA first public　 2016-07-14
ENA last update　 2016-07-13
External Id　 SAMEA4076830
INSDC center alias　 UCSDMI
INSDC center name　 University of California San Diego Microbiome Initiative
INSDC first public　 2016-07-14T17:01:39Z
INSDC last update　 2016-07-13T15:30:51Z
INSDC status　 public
Submitter Id　 qiita_sid_1222:1222.B5.5.6.06
afc_bacteria　 2818609.603
afc_coccolithopores　 183
afc_cryptophytes　 38
afc_large_picoeukaryotes　 2367
afc_nanoflagellates　 956
afc_small_picoeukaryotes　 6810
afc_synechoccus　 2380
alloxanthin　 0.02
altitude　 0
anonymized name　 B5-5.6.06
assigned_from_geo　 true
bb_carotene　 0.04
butfucoxanthin　 0
chlorophyl_b　 0.21
chlorophyl_c2　 0.15
chorophyll_c3　 0.03
collection date　 5/6/06 0:00
collection_timestamp　 05/06/2006
common name　 marine metagenome
country　 GAZ:Norway
d_vinyl_chl_b　 0
depth　 0
di_vinyl_chl_a　 0
diadinoxanthin　 0.13
diatoxanthin　 0.03
dna_extracted　 true
elevation　 44.1
empo_0　 EMP sample
empo_1　 Free-living
empo_2　 Saline
empo_3　 Water (saline)
env biome　 marine biome
env feature　 ocean
env matter　 sea water
env package　 water
env_material　 sea water
extracted DNA avail now　 true
fluorescence　 Missing: Not collected
fucoxanthin　 0.38
geo loc name　 Norway:Bergen
hexfucoxanthin　 0.06
host subject id　 B5-5.6.06
latitude　 60.27
longitude　 5.22
lutein　 0.02
neoxanthin　 0
nitrate　 0.18
org_carb　 338
org_nitro　 47
peridinin　 0.01
phosphate　 1.19
physical_specimen_location　 ANL
physical_specimen_remaining　 true
prasinoxanthin　 0
primary_prod　 Missing: Not collected
public　 true
required_sample_info_status　 completed
salinity　 Missing: Not collected
sample name　 qiita_sid_1222:1222.B5.5.6.06
sample type　 sea water
sample_progress　 sequenced (16S)
temp　 Missing: Not collected
violaxanthin　 0.03
zeaxanthin　 0.03
properties　▽ 
{...}
dbXrefs
bioproject　 PRJEB14793
sra-run　 ERR1530781
sra-submission　 ERA674239
biosample　 SAMEA4076830
sra-study　 ERP016464
sra-experiment　 ERX1601673
distribution JSONJSON-LD
Download
ERA674239.sample.xml　 HTTPS FTP
status public
visibility unrestricted-access
dateCreated 2016-07-15T18:44:52Z
dateModified 2021-09-24T10:03:13Z
datePublished 2016-07-15T19:17:27Z